Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms