Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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