Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PMS2P3Q13401 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms