Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms