Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5OP48047 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms