Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms