Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACO1P21399 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACO1P21399 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACO1P21399 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACO1P21399 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACO1P21399 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms