Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms