Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC39A12Q504Y0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms