Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q499Y3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q499Y3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q499Y3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms