Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms