Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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