Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms