Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms