Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms