Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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