Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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