Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYNGAP1Q96PV0 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms