Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms