Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms