Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGSM1Q2NKQ1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms