Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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