Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms