Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms