Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms