Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms