Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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LAMA5O15230 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LAMA5O15230 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LAMA5O15230 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LAMA5O15230 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LAMA5O15230 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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