Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms