Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms