Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms