Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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