Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 MTND4P30-201ENST00000450281 899 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SUCLG2P4-201ENST00000514739 1027 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC012150.1-201ENST00000553075 593 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL110292.1-201ENST00000550024 477 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LINC01304-203ENST00000453880 812 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LINC01697-204ENST00000458316 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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