Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXI1Q12951 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms