Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms