Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms