Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms