Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLD1P28340 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms