Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMNAP02545 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNAP02545 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNAP02545 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNAP02545 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNAP02545 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNAP02545 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNAP02545 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNAP02545 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMNAP02545 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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