Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms