Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms