Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF10P55107 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF10P55107 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF10P55107 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms