Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRCP23327 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRCP23327 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms