Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCP2P22307 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCP2P22307 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCP2P22307 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCP2P22307 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCP2P22307 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCP2P22307 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCP2P22307 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCP2P22307 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCP2P22307 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCP2P22307 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCP2P22307 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCP2P22307 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms