Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms