Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms