Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATF5Q9Y2D1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms