Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC8A2Q9UPR5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms