Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML1Q9UN30 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms