Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms