Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms